Основные направления работы отдела:

· Осуществляет сбор и анализ бухгалтерской отчетности федеральных государственных унитарных предприятий, подведомственных Министерству;

· Осуществляет сбор информации о просроченной кредиторской задолженности федеральных государственных бюджетных учреждений, подведомственных Министерству, учреждений, подведомственных Правительству Российской Федерации и доводит до сведения Министра информацию о превышении предельно допустимого значения просроченной кредиторской задолженности;

· Осуществляет сбор отчетности организаций, подведомственных Министерству, учреждений, подведомственных Правительству Российской Федерации, об использовании субсидии Федерального фонда обязательного медицинского страхования;

· Осуществляет сбор, формирование и представление в Межрегиональное бухгалтерское управление Федерального казначейства бухгалтерской отчетности организаций, подведомственных Министерству, находящихся за пределами Российской Федерации.